Zbirka obrta osnovana je 2017. godine reorganizacijom i izdvajanjem građe iz Zbirke umjetničkog obrta Kulturno-povijesnog odjela Muzeja. Osnivanjem ove zbirke omogućeno je prikupljanje vrijedne građe koja daje uvid u lokalno gospodarstvo i obrtničku aktivnost. U Zbirci obrta čuvaju se predmeti poput alata i pribora za rad različitih obrta kao i njihovi proizvodi. Tu su, primjerice, brave i okovi kao proizvod obrta za obradu metala, a veliku skupinu predmeta ove Zbirke čine alati i pribor za rad zlatarskog obrta. Alati i pribor za rad tradicijskih obrta dio su fundusa Etnografskog odjela, a onih vezanih uz pomorstvo Odjela za povijest pomorstva.